Я, собственно говоря, довольно терпимый в отношении личных фантазий в фанфикшене человек. Хочет автор - пусть он там себе пишет что пожелает, единственное - поставь в шапке фанфика все нужные дисклеймеры и креативь на здоровье что пожелаешь. Однако единственное, чего, ИМХО, следует избегать - это не выдавать неканон за канон. Либо, если уж ты хочешь писать по канону - следи за хронологией, канонными фактами, характерами, либо тогда уж честно ставь в шапке АУ и ООС. Кроме того, я считаю, что в фанфике по канону не должно быть место личным симпатиям и антипатиям. Если ты там не любишь или любишь конкретного героя, это твои личные трудности, в канонном фанфике места этому быть не должно, всему следует выглядеть именно как в каноне.
Однако, по моим наблюдениям, почему-то дикой неканоничностью страдают в основной своей массе творения иностранных авторов. Если в русских фэндомах сочинители при наличии отступлений от канона не ленятся ставить АУ и ООС, то применительно к зарубежным фэндомам мне попалось уже несколько работ, в которых автор вроде как претендует на каноничность, но при этом в фанфике просматривается полнейшее незнание канонных фактов, несоблюдение хронологии (или тоже полное ее незнание), а АУ и ООС такое, что самым махровым русским апокрифистам не снилось и в страшном сне.